التطوير التنظيمي لديوان وزارة النقل تولي وزارة الدولة للتنمية الإدارية اهتماما خاصاً بقطاع النقل نظراً لأهمية وحساسية الخدمات التي يقدمها للمواطنين على تنوع فئاتهم، ونظرا لضخامة حجم الاستثمارات التي يتم إنفاقها على تطوير هذا القطاع الحيوي.  ومن هنا فإن عملية التطوير تهدف إلى تحسين نوعية الخدمة المقدمة للمواطن، وإلى تحقيق اللامركزية، كما تهدف إلى تطبيق الأساليب الحديثة في مشاركة القطاع الخاص سواء من خلال نظام الاستعانة بمصادر خارجية (Outsourcing)  أو الشراكة بنظام البناء والتشغيل ونقل الملكية  (Build Operate Transfer) أو بنظام الشراكة بين القطاعين العام والخاص Public Private Partnership) )   وجميعها من الأساليب التي يمكن أن يقوم بها القطاع الخاص.  وفي هذا الإطار فقد قامت وزارة الدولة للتنمية الإدارية من خلال برنامج التطوير المؤسسي بالمساعدة في التطوير التنظيمي لديوان وزارة النقل حيث: تمت إعادة دراسة الهيكل التنظيمي، ووضع مقترح متكامل لتطويره تم وضع بطاقات وصف وظيفي للعاملين في ضوء الهيكل المقترح